Azt hiszem itt pontosan szükséges definiálni az anyag, tömeg és energia egymáshoz való viszonyát.
Úgy lehetne nagyon röviden jellemezni ezeket, hogy az anyag mozgásának mozgásállandói egyaránt a tömeg és az energia. Ezért a tömegtől és energiától csak annyit várhatunk el, mint egy egyszerű mozgásjellemzőtől, de nem azonosíthatjuk ezeket az anyaggal. Amikor azt mondjuk, hogy az energia tömeggé alakul, akkor nem azt mondjuk, hogy az energia anyaggá alakul!

A Newton-féle értelmezés és a relativitáselmélet e tekintetben abban különbözik egymástól, hogy a newtoni szerint a nyugvó anyag kinetikai energiája zérus, ezzel szemben a relativitáselmélet mc^2 energiájúnak tekinti, vagyis newtoni szemlélettel mondva, nyugvó állapotban számol az anyag belső energiájával.

A fény ha nem is nevezhető vákuumban tömegnek, azonban minden bizonnyal anyag.
Tehát amikor azon gondolkodsz, hogyan keletkezik a tömeg a semmiből, akkor ez jó kérdés, mert nem azt kérdezted, hogyan keletkezik az anyag a semmiből.