"Na de miért is lép be a "játékba" az atommag a gamma fotonok keletkezésénél???"
Ilyen nagy energia tipikusan magátalakulásoknál szabadul fel. Elképzelhető persze máshogy is, erősen felgyorsított részecskékkel.

"Felmerült bennem most egy kérdés: tegyük fel, van egy csomó hidrogén atommagunk egycsomóban. Az elektronjaikat elvittük jó messzire, szóval vannak egy csomóban és valahogy leküzdtük az elektrosztatikus taszítást is. Ez tud hőt lesugározni egy szem elektron nélkül?"

Termikus sugárzás akkor tud fellépni, ha nagyon sok lehetséges állapot van nagyon közeli energiaszinteken, így szinte mindenféle energiájú átmenet lehetséges bizonyos valószínűséggel. (ellenpélda a ritkított gázok sugárzása, mely alapvetően vonalas szerkezetű)
Proton is tud EM hullámokat kelteni, neki is van töltése.
Azt nehéz kicsit elképzelni, mi tartja össze a protonokat. Enélkül elég nehéz megmondani, milyen a lehetséges energiaállapotok sávszerkezete... :-)