A konfokális mikroszkóp egy fajta fluoreszcens mikroszkóp: Az atomokat gerjesztik - manapság lézerrel - az pedig egy nagyobb hullámhosszúságú fényt bocsájt ki.

Pl. UV gerjesztésre mindenféle látható színben pompázik egy csomó atom ill vegyültet, és a szín jellemző rájuk.

Konfokális pedig attól lesz, hogy nem az egész látómezőt gerjesztik, hanem csak egyetlen (térbeli) pontot és egy ügyes rekesszel kiszűrik azokat a fényeket, amit nem onnan (más pozíció vagy más magasság) jönnek.

Szóval ez a mikroszkóp a tárgynak csak egy pontját látja egyszerre, ezért soronként végig kell pásztázni a képet. Ha függőlegesen több réteget is végigpásztáz, akkor remek térbeli képet lehet összerakni belőle.

Ezt a pásztázást általában forgó-rezgő tükrökkel szokták csinálni (áll a tárgy is és az objektív is). Olyat, hogy az objektív rezeg, még nem hallottam (eddig).