A 2000/2001 szezon kezdetére jelentős átalakuláson ment át úgy a szakosztály irányítása és gazdálkodása, mint a csapat összetétele. A 2000-2003. évek közötti időszakban a csapat gerincét kisebb változásokkal olyan játékosok képezték, mint a válogatott Czigler László, Fodor Gergely, Mészáros Zalán és Sitku Ernő. A légiósok közül kiemelendő az egyik legjobb magyarországi légiósként nyilvántartott Terrence Davis vagy a küzdeni tudásáról ismert Vaidas Jurgilas. A csapat összetétele valamint a szakmai, szervezeti és gazdasági háttér megalapozta ezen évek soha nem látott sikereit, ami egy bajnoki címben (2002), két Magyar Kupa győzelemben (2001, 2003) egy bajnoki második (2001) és egy magyar kupa második (2002) helyezésben testesült meg.

A 2000/2001-es keret
#4 Terrence Davis
#5 Vaidas Jurgilas
#6 Érsek István
#7 Molnár Tamás
#8 Fodor Márton
#9 Czigler László
#10 Darius Lukminas (2001 januárig)
#10 Delmonte Madison (2001 januártól)
#11 Lőrincz Viktor
#12 Rajkó Zsolt
#13 Somodi Csaba
#14 Mészáros Zalán
#15 Lukács Attila

ügyvezető: Juhász Sándor
szakosztályelnök: Tóth János
vezetőedző: Fodor Péter
edző: Hirth Attila
technikai vezető: Plézer Gábor
masszőr: Hermann János
intéző: Schmidt Ferenc

Atomerőmű SE férfi kosárlabda szakosztály
Magyar Kupa 2000 - 2001



16 közé jutásért

2000. december PVSK – Atomerőmű SE 76-109 (6-33, 20-23, 23-28, 27-25)

Nyolcaddöntő

2001. január 18. MAFC – Atomerőmű SE 92-100 (19-24, 25-19, 22-32, 26-25)

Negyeddöntő

2001. március 03. MOL Szolnok – Atomerőmű SE 80-78 (18-18, 25-22, 21-18, 16-20)

2001. március 14. Atomerőmű SE – MOL Szolnok 83-67 (24-15, 15-13, 26-28, 18-11)

[161-147-es összesítéssel az Atomerőmű SE csapata jutott tovább]

Négyes Döntő, Kaposvár

Elődöntők - 2001. március 23., péntek

2001. március 23. Kaposvár Klíma Vill Purina KK – Marc Körmend 75-59

2001. március 23. Atomerőmű SE – Albacomp-UPC 88-79 (22-27, 18-21, 20-13, 28-1

Harmadik helyért - 2001. március 24., szombat

2001. március 24. Albacomp-UPC – Marc Körmend 100-69

Döntő - 2001. március 24., szombat

2001. március 24. Kaposvár Klíma Vill Purina KK – Atomerőmű SE 82-94 (25-24, 24-20, 14-19, 19-31)

A Magyar Kupa végeredménye:

1. Atomerőmű SE
2. Kaposvár Klíma Vill Purina KK
3. Albacomp-UPC
4. Marc Körmend