Keresés

Részletes keresés

ad5lib Creative Commons License 2006-02-06 19:27:40 77
Na meg egy valasz aztan huzok sportolni.:)


ugyanazon tumor két részéből, vagy két különböző időpontban vett (pl. biopsziás) mintából indulnál ki

Szerintem meglepodnel. Ha sejteket veszel ki a tumor core-bol ahol massziv hypoxia van es acidozis vagy a szeli reszekbol igen nagy kulonbseget talalnal. (ezert szivok a genterapiammal:) A primer tumor es metasztazis kozott is eleg nagy kulonbseg van. OK: Szerintem. A fonokom szerint nem. De ha belegondolsz, hogy a tumorsejtnek elobb EMT kell csinalnia aztan extravasal aztan vandorol tuleli a keringest majd megint kilep majd ujrainditja az osztodasi prograomt alkalmazkodik a kornyezethez stb. Szoval ha ezek utan egy az egyben ugyanaz a genexpresszioja akkor en meg lennek lepodve.

Az eger xenograft nem jo pelda. Ha van egy primer tumorod amibol csinalsz egy sejtkulturat egyet hypoxiaban masikat normoxiaban mi lesz? Mig a normoxias sejtek 0.01% fog tumort csinalni (jobb esetben) addig a hypoxias sejteknek 50%-a (ezt nem en talaltam ki de Jerry Shaynek talan hiszel:) . Mire bizonyitek ez. Hogy a sejtek alkalmazkodnak a muanyaghoz, megvaltoztatjak a genexpresszit aztan nagy nehezen ujra alkalmazkodnak a relative termeszetesebb kornyezethez. ( A xenograftok nagyreszet sejtvonalbol csinaljak szvsz.)
Masreszt ez reszben bizonyitek az uj mania a cancer stem cell letezese ellen is.

A hozzászólás:
grandmaestro Creative Commons License 2006-02-06 19:11:42 74

a "csak részben reprezentálja" nekem OK, az "egyáltalán nem" kifejezésen akadtam meg...

 

>>A primer tumor es a belole inditott sejtvonal mennyi ideig orzi meg a genexpresszios profiljat? Sosem lattam olyan tanulmanyt ami ezt igazolta volna<<

 

nem sokáig, az biztos... különösen nem a kromoszómainstabilitást mutató tumoroknál (az a szolid tumorok többségénél)... ami azt is jelenti, hogy a már meglévő mutációk hátperszehogy nem vesznek el, viszont hamar lesznek újabbak, nem is beszélve a kromoszómatörésekről, deléciókról, stb.

 

>>De a legtobb hasznalt sejtvonal Hela, 293T etc mar passage 100 es koze nincs az eredetihez<<

 

metabolizmusában? vagy úgy általában? mert azért az azonosításra még mindig elfogadott a törvényszéki személyazonosításban is használt mikro/miniszatellita markersorok jellemző allélnagysága (ezeket jó esetben megadja a bank, és ellenőrizhetem, hogy még mindig tényleg ugyanazzal a vonallal dolgozom-e, amit anno megvettem). A 100 passage tényleg sok - de ezzel kapcsolatos konkrét méréseket-kísérleteket én sem olvastam még; itt az ideje egy közös Index-publikációnak, amúgy becenevekkel... :-))

 

>>Azt pedig tovabbra is efntartom, hogy a metabolizmusa tumor sejteknek megvaltozik a szovettenyesztes hatasara<<

 

ezt nem is vitatom...

 

>>Azt hogy az expresszio is megvaltozik csak hallottam, Jerry Shaytol (o klonozta a hTERT ha jol emlekszem)<<

 

Jól emlékszel... :-))

Bizonyos expressziók biztosan megváltoznak, de a reprezentáltságot mégiscsak egy profil-kép megőrződésében látom, több száz/ezer génnel jellemezve... azaz nem lesznek nagyobbak a különbségek, mintha ugyanazon tumor két részéből, vagy két különböző időpontban vett (pl. biopsziás) mintából indulnál ki. (Persze tényleg csak viszonylag rövid ideig, a HeLa esetében azonosságot várni talán tényleg dőreség lenne)

(számomra kicsit ahhoz hasonlít a helyzet, ahogy a fenti profil megőrződik akkor is, ha a tumor más szervbe képez áttétet, vagy ha pl. egérbe xenograftolva növesztik)

Előzmény:
ad5lib Creative Commons License 2006-02-06 18:52:52 73
Tovabbra is fenntartom, hogy csak reszben reprezentalja. A muatciok, amplifikaciok deleciok amik a sejtben letrejottek nyilvan nem fognak megvaltozni.

A primer tumor es a belole inditott sejtvonal mennyi ideig orzi meg a genexpresszios profiljat? Sosem lattam olyan tanulmanyt ami ezt igazolta volna. Azt nem allitom, hogy ha holnap neki allsz es egy primer tumorbol csinalsz egy sejtvonalat akkor nehany passage utan (max 5) meg mindig hasonloak lesznek. De a legtobb hasznalt sejtvonal Hela, 293T etc mar passage 100 es koze nincs az eredetihez. Azt pedig tovabbra is efntartom, hogy a metabolizmusa tumor sejteknek megvaltozik a szovettenyesztes hatasara. Azt hogy az expresszio is megvaltozik csak hallottam, Jerry Shaytol (o klonozta a hTERT ha jol emlekszem)

Ha kedveled azért, ha nem azért nyomj egy lájkot a Fórumért!