a "csak részben reprezentálja" nekem OK, az "egyáltalán nem" kifejezésen akadtam meg...
>>A primer tumor es a belole inditott sejtvonal mennyi ideig orzi meg a genexpresszios profiljat? Sosem lattam olyan tanulmanyt ami ezt igazolta volna<<
nem sokáig, az biztos... különösen nem a kromoszómainstabilitást mutató tumoroknál (az a szolid tumorok többségénél)... ami azt is jelenti, hogy a már meglévő mutációk hátperszehogy nem vesznek el, viszont hamar lesznek újabbak, nem is beszélve a kromoszómatörésekről, deléciókról, stb.
>>De a legtobb hasznalt sejtvonal Hela, 293T etc mar passage 100 es koze nincs az eredetihez<<
metabolizmusában? vagy úgy általában? mert azért az azonosításra még mindig elfogadott a törvényszéki személyazonosításban is használt mikro/miniszatellita markersorok jellemző allélnagysága (ezeket jó esetben megadja a bank, és ellenőrizhetem, hogy még mindig tényleg ugyanazzal a vonallal dolgozom-e, amit anno megvettem). A 100 passage tényleg sok - de ezzel kapcsolatos konkrét méréseket-kísérleteket én sem olvastam még; itt az ideje egy közös Index-publikációnak, amúgy becenevekkel... :-))
>>Azt pedig tovabbra is efntartom, hogy a metabolizmusa tumor sejteknek megvaltozik a szovettenyesztes hatasara<<
ezt nem is vitatom...
>>Azt hogy az expresszio is megvaltozik csak hallottam, Jerry Shaytol (o klonozta a hTERT ha jol emlekszem)<<
Jól emlékszel... :-))
Bizonyos expressziók biztosan megváltoznak, de a reprezentáltságot mégiscsak egy profil-kép megőrződésében látom, több száz/ezer génnel jellemezve... azaz nem lesznek nagyobbak a különbségek, mintha ugyanazon tumor két részéből, vagy két különböző időpontban vett (pl. biopsziás) mintából indulnál ki. (Persze tényleg csak viszonylag rövid ideig, a HeLa esetében azonosságot várni talán tényleg dőreség lenne)
(számomra kicsit ahhoz hasonlít a helyzet, ahogy a fenti profil megőrződik akkor is, ha a tumor más szervbe képez áttétet, vagy ha pl. egérbe xenograftolva növesztik) |