Keresés

Részletes keresés

grandmaestro Creative Commons License 2006-02-06 19:19:05 75

apropo, J Shay biztosan a tumorsejtek sejtvonallá alakításáról beszélt, és nem arról, amikor normál sejtekből, pl. vérből indítok egy vonalat?

Merthogy utóbbi esetben tényleg nem jó a reprezentáltság; vagy az EBV-transzformációval lököm szét az egész sejtciklust a retinoblastoma fehérjén (és minden partnerén) keresztül, befolyásolva ezzel szinte mindent, vagy ha külső telomerázexpresszióval immortalizálok, akkor meg a TERT-partnerek szabályozásába piszkálok bele, köztük a myc onkogénébe is, ami meg transzkripciós faktorként olyan lavinát indít, hogy tényleg az anyja se ismer rá arra a limfoblasztoid vonalra... (mégis vannak cégek, amelyeknek jól megy a bér-immortalizálási üzlet...)

grandmaestro Creative Commons License 2006-02-06 19:11:42 74

a "csak részben reprezentálja" nekem OK, az "egyáltalán nem" kifejezésen akadtam meg...

 

>>A primer tumor es a belole inditott sejtvonal mennyi ideig orzi meg a genexpresszios profiljat? Sosem lattam olyan tanulmanyt ami ezt igazolta volna<<

 

nem sokáig, az biztos... különösen nem a kromoszómainstabilitást mutató tumoroknál (az a szolid tumorok többségénél)... ami azt is jelenti, hogy a már meglévő mutációk hátperszehogy nem vesznek el, viszont hamar lesznek újabbak, nem is beszélve a kromoszómatörésekről, deléciókról, stb.

 

>>De a legtobb hasznalt sejtvonal Hela, 293T etc mar passage 100 es koze nincs az eredetihez<<

 

metabolizmusában? vagy úgy általában? mert azért az azonosításra még mindig elfogadott a törvényszéki személyazonosításban is használt mikro/miniszatellita markersorok jellemző allélnagysága (ezeket jó esetben megadja a bank, és ellenőrizhetem, hogy még mindig tényleg ugyanazzal a vonallal dolgozom-e, amit anno megvettem). A 100 passage tényleg sok - de ezzel kapcsolatos konkrét méréseket-kísérleteket én sem olvastam még; itt az ideje egy közös Index-publikációnak, amúgy becenevekkel... :-))

 

>>Azt pedig tovabbra is efntartom, hogy a metabolizmusa tumor sejteknek megvaltozik a szovettenyesztes hatasara<<

 

ezt nem is vitatom...

 

>>Azt hogy az expresszio is megvaltozik csak hallottam, Jerry Shaytol (o klonozta a hTERT ha jol emlekszem)<<

 

Jól emlékszel... :-))

Bizonyos expressziók biztosan megváltoznak, de a reprezentáltságot mégiscsak egy profil-kép megőrződésében látom, több száz/ezer génnel jellemezve... azaz nem lesznek nagyobbak a különbségek, mintha ugyanazon tumor két részéből, vagy két különböző időpontban vett (pl. biopsziás) mintából indulnál ki. (Persze tényleg csak viszonylag rövid ideig, a HeLa esetében azonosságot várni talán tényleg dőreség lenne)

(számomra kicsit ahhoz hasonlít a helyzet, ahogy a fenti profil megőrződik akkor is, ha a tumor más szervbe képez áttétet, vagy ha pl. egérbe xenograftolva növesztik)

A hozzászólás:
ad5lib Creative Commons License 2006-02-06 18:52:52 73
Tovabbra is fenntartom, hogy csak reszben reprezentalja. A muatciok, amplifikaciok deleciok amik a sejtben letrejottek nyilvan nem fognak megvaltozni.

A primer tumor es a belole inditott sejtvonal mennyi ideig orzi meg a genexpresszios profiljat? Sosem lattam olyan tanulmanyt ami ezt igazolta volna. Azt nem allitom, hogy ha holnap neki allsz es egy primer tumorbol csinalsz egy sejtvonalat akkor nehany passage utan (max 5) meg mindig hasonloak lesznek. De a legtobb hasznalt sejtvonal Hela, 293T etc mar passage 100 es koze nincs az eredetihez. Azt pedig tovabbra is efntartom, hogy a metabolizmusa tumor sejteknek megvaltozik a szovettenyesztes hatasara. Azt hogy az expresszio is megvaltozik csak hallottam, Jerry Shaytol (o klonozta a hTERT ha jol emlekszem)
Előzmény:
grandmaestro Creative Commons License 2006-02-06 18:43:55 72

>>az egesz jelenlegi sejtszaporitasi technika es a belole szarmazo eredmenyek is reszben falsak. Ha kiveszel egy human tumort es probalod normalis oxigenen szaporitani nagyon keves sejt eli tul a szaporitast es ezekbol lettek a ma is hasznalt sejtvonalak. Igy egy olyan populaciot hasznalunk ami egyaltalan nem reprezentalja a valodi tumorsejteket<<

 

megengedve, hogy a setjvonalazás nem a legreprezentatívabb dolog, az "eygáltalán nem reprezentálja" nem túlzás egy kicsit? Nekem úgy rémlik, hogy összehasonlítva a primer tumor és a belőle indított sejtvonal génexpressziós profilját meglehetősen jó egyezések jönnek ki. Rosszul emlékszem?

A tumor reprezentálása felé szerintem amúgy sem "a jó tumorsejtek kiválasztása" visz, hanem inkább a szövetszerű kultúrába vonás (mátrix, szomszéd sejtek, miegymás, 3D sejttenyésztés...)

Ha kedveled azért, ha nem azért nyomj egy lájkot a Fórumért!