Cygwin leszed, telepít. Ezután lesz egy bash-környezeted, meg minden, amit még telepítesz hozzá, akár X is. Shell scriptek futtatására tökéletes, sőt, a win-ben lévő szalagos egységeket is lehet kezelni a cygwin-en keresztül, úgyhogy kiváló mentési scripteket lehet akár még ilyen eszközökhöz is írni alá (pl. awk, tar és hasonló finomságok használata).